| 3. Round | 26/07/2009 | Cúcuta Deportivo | - | Deportes Quindío | 2:0 | ||||
| 4. Round | 02/08/2009 | Deportes Quindío | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| 5. Round | 09/08/2009 | Once Caldas | - | Deportes Quindío | 2:0 | ||||
| 6. Round | 16/08/2009 | Deportes Quindío | - | Deportivo Pasto | 2:1 | ||||
| 7. Round | 23/08/2009 | Deportivo Cali | - | Deportes Quindío | 2:1 |  |
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| 8. Round | 29/08/2009 | Deportes Quindío | - | Real Cartagena | 3:2 |  |
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| 9. Round | 13/09/2009 | Deportes Quindío | - | Boyacá Chicó | 1:3 | ||||
| 10. Round | 20/09/2009 | Boyacá Chicó | - | Deportes Quindío | 3:1 | |
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| 11. Round | 28/09/2009 | Deportes Quindío | - | Santa Fe | 3:1 | ||||
| 12. Round | 04/10/2009 | Envigado FC | - | Deportes Quindío | 3:0 | |
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| 15. Round | 25/10/2009 | Deportes Quindío | - | La Equidad | 2:2 |  |
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| 18. Round | 15/11/2009 | Atlético Huila | - | Deportes Quindío | 0:0 |
Argentina