| 2. Round | 16/01/2016 | Santos Laguna | - | Chiapas FC | 1:0 |  |
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| 3. Round | 24/01/2016 | Chiapas FC | - | CD Veracruz | 1:1 | ||||
| 4. Round | 30/01/2016 | Cruz Azul | - | Chiapas FC | 2:1 | ||||
| 5. Round | 06/02/2016 | Chiapas FC | - | UANL Tigres | 1:3 | ||||
| 7. Round | 21/02/2016 | Chiapas FC | - | Deportivo Guadalajara | 1:1 | ||||
| 9. Round | 06/03/2016 | Chiapas FC | - | Deportivo Toluca | 3:2 | ||||
| 10. Round | 13/03/2016 | Chiapas FC | - | Club Tijuana | 1:2 |  |
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| 11. Round | 19/03/2016 | Gallos Blancos | - | Chiapas FC | 1:1 | ||||
| 6. Round | 27/03/2016 | Monarcas Morelia | - | Chiapas FC | 2:0 | ||||
| 12. Round | 03/04/2016 | Chiapas FC | - | CF América | 0:2 | ||||
| 13. Round | 10/04/2016 | CF Monterrey | - | Chiapas FC | 6:0 | ||||
| 14. Round | 17/04/2016 | Chiapas FC | - | Pumas UNAM | 1:2 | ||||
| 15. Round | 24/04/2016 | Puebla FC | - | Chiapas FC | 2:1 | |
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| 17. Round | 08/05/2016 | CF Pachuca | - | Chiapas FC | 2:1 |
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