| 1. Round | 24/08/2008 | Trabzonspor | - | Ankaraspor | 2:0 | ||||
| 4. Round | 19/09/2008 | Denizlispor | - | Trabzonspor | 0:1 | ||||
| 5. Round | 27/09/2008 | Trabzonspor | - | Antalyaspor | 3:2 | ||||
| 8. Round | 26/10/2008 | Trabzonspor | - | Gaziantepspor | 1:1 | ||||
| 11. Round | 14/11/2008 | Gençlerbirliği | - | Trabzonspor | 0:1 | ||||
| 12. Round | 23/11/2008 | Trabzonspor | - | Sivasspor | 0:0 | ||||
| 13. Round | 28/11/2008 | Kayserispor | - | Trabzonspor | 1:1 | ||||
| 14. Round | 07/12/2008 | Trabzonspor | - | Kocaelispor | 2:1 | ||||
| 16. Round | 20/12/2008 | Trabzonspor | - | Eskişehirspor | 2:1 | ||||
| 17. Round | 25/01/2009 | Fenerbahçe | - | Trabzonspor | 0:0 | ||||
| 19. Round | 06/02/2009 | Trabzonspor | - | MKE Ankaragücü | 2:1 | ||||
| 21. Round | 21/02/2009 | Trabzonspor | - | Denizlispor | 0:2 | ||||
| 27. Round | 11/04/2009 | Hacettepe | - | Trabzonspor | 1:4 |  |
|||
| 33. Round | 24/05/2009 | Eskişehirspor | - | Trabzonspor | 2:5 |  |
|||
| 34. Round | 30/05/2009 | Trabzonspor | - | Fenerbahçe | 1:2 |
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