| 5. Round | 03/09/1999 | Gimnasia de Jujuy | - | Independiente | 1:4 |  |
|||
| 6. Round | 11/09/1999 | Independiente | - | River Plate | 1:1 | ||||
| 8. Round | 23/09/1999 | Independiente | - | Unión de Santa Fe | 0:0 | ||||
| 9. Round | 02/10/1999 | Gimnasia de La Plata | - | Independiente | 2:0 |  |
|||
| 10. Round | 09/10/1999 | Independiente | - | Talleres de Córdoba | 2:1 | ||||
| 11. Round | 16/10/1999 | Racing Club | - | Independiente | 0:0 | ||||
| 12. Round | 28/10/1999 | Independiente | - | Chacarita Juniors | 1:0 | ||||
| 13. Round | 07/11/1999 | Ferro Carril Oeste | - | Independiente | 0:2 | ||||
| 14. Round | 13/11/1999 | Independiente | - | San Lorenzo | 0:3 | ||||
| 15. Round | 19/11/1999 | Instituto de Córdoba | - | Independiente | 2:1 | ||||
| 17. Round | 03/12/1999 | Colón de Santa Fe | - | Independiente | 1:2 | |
|||
| 18. Round | 09/12/1999 | Independiente | - | Estudiantes | 0:0 | ||||
| 19. Round | 17/12/1999 | Belgrano de Córdoba | - | Independiente | 2:3 | |
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