| 2. Round | 16/07/2016 | Spartak Moskva 2 | - | Mordovia Saransk | 2:0 | ||||
| 14. Round | 26/09/2016 | Luch-Energiya Vladivostok | - | Spartak Moskva 2 | 0:0 | ||||
| 20. Round | 05/11/2016 | Mordovia Saransk | - | Spartak Moskva 2 | 1:4 | ||||
| 21. Round | 09/11/2016 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Spartak Moskva 2 | 5:2 | ||||
| 22. Round | 13/11/2016 | Spartak Moskva 2 | - | Fakel Voronezh | 1:0 | ||||
| 23. Round | 19/11/2016 | Sokol Saratov | - | Spartak Moskva 2 | 0:4 | ||||
| 24. Round | 26/11/2016 | Spartak Moskva 2 | - | Shinnik Yaroslavl | 1:2 | ||||
| 33. Round | 23/04/2017 | FK Neftekhimik | - | Spartak Moskva 2 | 0:1 | ||||
| 35. Round | 06/05/2017 | Spartak Moskva 2 | - | FK Tambov | 1:2 | ||||
| 37. Round | 14/05/2017 | Spartak Moskva 2 | - | FK Khimki | 4:0 | ||||
| 38. Round | 20/05/2017 | Sibir Novosibirsk | - | Spartak Moskva 2 | 2:1 |
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