| 1. Round | 03/08/2012 | Blooming | - | Universidad Católica | 1:1 | ||||
| 1. Round | 10/08/2012 | Universidad Católica | - | Blooming | 3:0 | ||||
| 2. Round | 30/08/2012 | Universidad Católica | - | Deportes Tolima | 2:0 | ||||
| 2. Round | 19/09/2012 | Deportes Tolima | - | Universidad Católica | 3:1 | ||||
| Round of 16 | 24/10/2012 | Atlético Goianiense | - | Universidad Católica | 3:1 |  |
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| Quarter-finals | 02/11/2012 | Independiente | - | Universidad Católica | 2:2 | ||||
| Semi-finals | 22/11/2012 | Universidad Católica | - | São Paulo FC | 1:1 | ||||
| Semi-finals | 28/11/2012 | São Paulo FC | - | Universidad Católica | 0:0 |
Chile