| 3. Round | 10/09/2016 | Almagro | - | Boca Unidos | 0:0 | ||||
| 4. Round | 17/09/2016 | Boca Unidos | - | Central Córdoba SdE | 2:0 | ||||
| 8. Round | 08/10/2016 | Flandria | - | Boca Unidos | 0:0 | ||||
| 9. Round | 13/10/2016 | Boca Unidos | - | Juventud Unida de Gualeguaychú | 1:3 | ||||
| 10. Round | 17/10/2016 | CA Los Andes | - | Boca Unidos | 2:1 | ||||
| 12. Round | 30/10/2016 | Nueva Chicago | - | Boca Unidos | 2:2 |  |
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| 14. Round | 13/11/2016 | Instituto de Córdoba | - | Boca Unidos | 1:0 | ||||
| 15. Round | 19/11/2016 | Boca Unidos | - | Chacarita Juniors | 1:0 | ||||
| 16. Round | 24/11/2016 | San Martín de Tucumán | - | Boca Unidos | 2:0 | ||||
| 17. Round | 28/11/2016 | Boca Unidos | - | Crucero del Norte | 2:1 | |
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| 18. Round | 05/12/2016 | Estudiantes de San Luis | - | Boca Unidos | 1:1 | ||||
| 19. Round | 09/12/2016 | Boca Unidos | - | Douglas Haig | 3:1 | |
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| 20. Round | 15/12/2016 | Villa Dálmine | - | Boca Unidos | 1:0 | |
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| 21. Round | 18/12/2016 | Boca Unidos | - | Atlético Paraná | 3:0 | |
Argentina