| 17. Round | 14/01/2017 | Manisaspor | - | Boluspor | 2:2 | ||||
| 18. Round | 21/01/2017 | Elazığspor | - | Manisaspor | 2:2 | ||||
| 19. Round | 29/01/2017 | Manisaspor | - | Ümraniyespor | 5:2 |  |
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| 20. Round | 11/02/2017 | Eskişehirspor | - | Manisaspor | 1:5 | |
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| 21. Round | 18/02/2017 | Manisaspor | - | Giresunspor | 1:2 | |
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| 23. Round | 05/03/2017 | Manisaspor | - | Bandırmaspor | 6:2 | ||||
| 24. Round | 12/03/2017 | Adana Demirspor | - | Manisaspor | 1:1 | ||||
| 25. Round | 18/03/2017 | Manisaspor | - | Yeni Malatyaspor | 0:2 | ||||
| 26. Round | 02/04/2017 | Sivasspor | - | Manisaspor | 2:0 | ||||
| 27. Round | 09/04/2017 | Manisaspor | - | Mersin Idmanyurdu | 2:0 | |
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| 29. Round | 24/04/2017 | Manisaspor | - | Denizlispor | 3:2 | |
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| 30. Round | 30/04/2017 | Gaziantep Bld.Spor | - | Manisaspor | 1:0 | ||||
| 31. Round | 04/05/2017 | Manisaspor | - | Altınordu FK | 0:2 | ||||
| 32. Round | 08/05/2017 | Balıkesirspor | - | Manisaspor | 1:2 | |
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| 33. Round | 14/05/2017 | Manisaspor | - | Şanlıurfaspor | 2:0 | |
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