| 1. Round | 27/08/2016 | Atlético Paraná | - | Flandria | 0:2 | ||||
| 2. Round | 03/09/2016 | Flandria | - | Brown de Adrogué | 0:1 |  |
|||
| 3. Round | 11/09/2016 | Guillermo Brown | - | Flandria | 0:1 | |
|||
| 4. Round | 17/09/2016 | Flandria | - | All Boys | 1:2 | ||||
| 5. Round | 22/09/2016 | Ferro Carril Oeste | - | Flandria | 3:0 | ||||
| 8. Round | 08/10/2016 | Flandria | - | Boca Unidos | 0:0 | ||||
| 10. Round | 16/10/2016 | Flandria | - | Ramón Santamarina | 0:0 | ||||
| 12. Round | 29/10/2016 | Juventud Unida de Gualeguaychú | - | Flandria | 0:0 | |
|||
| 6. Round | 02/11/2016 | Flandria | - | Almagro | 1:0 | ||||
| 13. Round | 06/11/2016 | Flandria | - | CA Los Andes | 1:1 | ||||
| 14. Round | 13/11/2016 | Gimnasia de Jujuy | - | Flandria | 0:1 | |
|||
| 15. Round | 19/11/2016 | Flandria | - | Nueva Chicago | 0:1 | |
|||
| 17. Round | 28/11/2016 | Flandria | - | Instituto de Córdoba | 1:3 | ||||
| 18. Round | 03/12/2016 | Chacarita Juniors | - | Flandria | 3:2 | |
Argentina