| 15. Round | 04/01/2012 | AO Kerkyra | - | Aris Saloniki | 1:0 |  |
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| 16. Round | 08/01/2012 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 17. Round | 15/01/2012 | AO Kerkyra | - | Asteras Tripolis | 0:0 | ||||
| 18. Round | 22/01/2012 | Panetolikos | - | AO Kerkyra | 1:1 |  |
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| 19. Round | 28/01/2012 | Panionios GSS | - | AO Kerkyra | 2:0 | ||||
| 20. Round | 04/02/2012 | AO Kerkyra | - | PAS Giannina | 1:2 | ||||
| 21. Round | 12/02/2012 | Atromitos | - | AO Kerkyra | 3:1 | |
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| 22. Round | 19/02/2012 | AO Kerkyra | - | Doxa Dramas FC | 3:1 | ||||
| 23. Round | 04/03/2012 | Levadiakos | - | AO Kerkyra | 4:3 | ||||
| 8. Round | 07/03/2012 | AO Kerkyra | - | Levadiakos | 3:2 | ||||
| 24. Round | 11/03/2012 | AO Kerkyra | - | Skoda Xanthi | 2:0 | |
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| 25. Round | 17/03/2012 | Ergotelis | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 26. Round | 25/03/2012 | AO Kerkyra | - | PAOK Saloniki | 0:4 |
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