| 1. Round | 06/08/2006 | Colón de Santa Fe | - | Independiente | 1:4 | ||||
| 2. Round | 13/08/2006 | Independiente | - | Belgrano de Córdoba | 3:1 | ||||
| 3. Round | 19/08/2006 | Boca Juniors | - | Independiente | 1:0 | ||||
| 4. Round | 27/08/2006 | Independiente | - | Banfield | 2:1 |  |
|||
| 5. Round | 02/09/2006 | Rosario Central | - | Independiente | 2:2 | |
|||
| 6. Round | 10/09/2006 | Lanús | - | Independiente | 2:4 | ||||
| 7. Round | 17/09/2006 | Independiente | - | San Lorenzo | 0:1 | ||||
| 8. Round | 23/09/2006 | Estudiantes | - | Independiente | 2:1 | |
|||
| 9. Round | 01/10/2006 | Independiente | - | Gimnasia de La Plata | 3:0 | ||||
| 10. Round | 07/10/2006 | Godoy Cruz | - | Independiente | 3:1 | ||||
| 11. Round | 15/10/2006 | Independiente | - | Nueva Chicago | 3:2 | ||||
| 12. Round | 22/10/2006 | Vélez Sarsfield | - | Independiente | 2:1 | |
|||
| 14. Round | 05/11/2006 | Newell's Old Boys | - | Independiente | 0:1 | ||||
| 15. Round | 12/11/2006 | Independiente | - | Racing Club | 2:0 | ||||
| 16. Round | 18/11/2006 | Argentinos Juniors | - | Independiente | 2:0 | ||||
| 17. Round | 26/11/2006 | Independiente | - | Arsenal de Sarandí | 2:1 |  |
|
||
| 18. Round | 02/12/2006 | Quilmes | - | Independiente | 1:3 | ||||
| 19. Round | 08/12/2006 | Independiente | - | Gimnasia de Jujuy | 1:2 |
Argentina