| Group 2 | 11/03/2003 | Paysandu - PA | - | Universidad Católica | 3:1 | ||||
| Group 2 | 18/03/2003 | Paysandu - PA | - | Sporting Cristal | 2:1 | ||||
| Group 2 | 27/03/2003 | Cerro Porteño | - | Paysandu - PA | 2:6 | ||||
| Group 2 | 16/04/2003 | Universidad Católica | - | Paysandu - PA | 1:1 | ||||
| Round of 16 | 25/04/2003 | Boca Juniors | - | Paysandu - PA | 0:1 | ||||
| Round of 16 | 16/05/2003 | Paysandu - PA | - | Boca Juniors | 2:4 |  |
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