| 1. Round | 31/07/2004 | Preußen Münster | - | Fortuna Düsseldorf | 1:0 | ||||
| 2. Round | 07/08/2004 | VfB Lübeck | - | Preußen Münster | 3:0 | ||||
| 3. Round | 11/08/2004 | Preußen Münster | - | Chemnitzer FC | 1:0 | ||||
| 4. Round | 15/08/2004 | Werder Bremen II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 6. Round | 29/08/2004 | Preußen Münster | - | Eintracht Braunschweig | 0:5 | ||||
| 7. Round | 04/09/2004 | VfL Wolfsburg II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 8. Round | 14/09/2004 | Preußen Münster | - | KFC Uerdingen 05 | 1:2 | ||||
| 9. Round | 18/09/2004 | Hertha BSC II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 14. Round | 23/10/2004 | Preußen Münster | - | Hamburger SV II | 1:4 | ||||
| 16. Round | 06/11/2004 | Preußen Münster | - | 1. FC Union Berlin | 0:0 | ||||
| 17. Round | 13/11/2004 | SC Paderborn 07 | - | Preußen Münster | 3:2 |  |
|||
| 18. Round | 20/11/2004 | Preußen Münster | - | Arminia Bielefeld II | 2:0 | ||||
| 21. Round | 11/12/2004 | Preußen Münster | - | VfB Lübeck | 1:2 |
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