| 2. Round | 05/08/2016 | VfB Oldenburg | - | Hannover 96 II | 0:2 | ||||
| 21. Round | 11/02/2017 | Hannover 96 II | - | SV Eichede | 1:2 | ||||
| 22. Round | 19/02/2017 | TSV Havelse | - | Hannover 96 II | 0:0 |  |
|||
| 24. Round | 06/03/2017 | Hannover 96 II | - | Eintracht Braunschweig II | 2:3 | ||||
| 25. Round | 12/03/2017 | ETSV Weiche Flensburg | - | Hannover 96 II | 1:0 | ||||
| 20. Round | 15/03/2017 | Hamburger SV II | - | Hannover 96 II | 1:0 | ||||
| 26. Round | 18/03/2017 | Hannover 96 II | - | Schwarz-Weiß Rehden | 1:1 | ||||
| 28. Round | 01/04/2017 | Hannover 96 II | - | Germania Egestorf/Langreder | 0:1 | ||||
| 23. Round | 04/04/2017 | U.S.I. Lupo-Martini | - | Hannover 96 II | 0:2 | ||||
| 29. Round | 07/04/2017 | FC St. Pauli II | - | Hannover 96 II | 0:0 | ||||
| 30. Round | 22/04/2017 | Hannover 96 II | - | VfB Lübeck | 3:0 | ||||
| 31. Round | 28/04/2017 | SV Drochtersen/Assel | - | Hannover 96 II | 4:1 | ||||
| 32. Round | 08/05/2017 | Hannover 96 II | - | VfL Wolfsburg II | 1:0 |
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