| 2. Round | 18/08/2012 | Boca Unidos | - | Rosario Central | 1:2 | ||||
| 3. Round | 26/08/2012 | Deportivo Merlo | - | Boca Unidos | 1:0 |  |
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| 4. Round | 02/09/2012 | Boca Unidos | - | Sarmiento de Junín | 0:0 | ||||
| 5. Round | 11/09/2012 | Instituto de Córdoba | - | Boca Unidos | 0:0 | ||||
| 6. Round | 17/09/2012 | Huracán | - | Boca Unidos | 0:2 | |
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| 7. Round | 24/09/2012 | Boca Unidos | - | Banfield | 2:0 | |
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| 8. Round | 29/09/2012 | Nueva Chicago | - | Boca Unidos | 0:0 | |
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| 9. Round | 07/10/2012 | Boca Unidos | - | Olimpo de Bahía Blanca | 0:1 | ||||
| 10. Round | 14/10/2012 | Atlético Tucumán | - | Boca Unidos | 2:3 | ||||
| 11. Round | 21/10/2012 | Boca Unidos | - | Patronato de Paraná | 0:1 | ||||
| 12. Round | 27/10/2012 | Independiente Rivadavia | - | Boca Unidos | 3:0 | |
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| 24. Round | 10/03/2013 | Boca Unidos | - | Instituto de Córdoba | 1:1 | ||||
| 25. Round | 16/03/2013 | Boca Unidos | - | Huracán | 0:1 | |
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