| 6. Round | 25/09/2016 | RCD Mallorca B | - | FC Barcelona B | 2:3 |  |
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| 7. Round | 01/10/2016 | CE Sabadell | - | RCD Mallorca B | 1:1 | ||||
| 8. Round | 09/10/2016 | RCD Mallorca B | - | UE Llagostera | 4:0 | ||||
| 9. Round | 15/10/2016 | Valencia CF B | - | RCD Mallorca B | 0:2 | ||||
| 12. Round | 02/11/2016 | RCD Mallorca B | - | Lleida Esportiu | 0:0 | ||||
| 14. Round | 13/11/2016 | RCD Mallorca B | - | AE Prat | 0:0 | ||||
| 16. Round | 27/11/2016 | RCD Mallorca B | - | CD Ebro | 0:0 | ||||
| 20. Round | 08/01/2017 | CD Alcoyano | - | RCD Mallorca B | 1:0 | ||||
| 22. Round | 22/01/2017 | RCD Mallorca B | - | Levante UD B | 0:0 | ||||
| 23. Round | 28/01/2017 | UE Cornellà | - | RCD Mallorca B | 1:2 | ||||
| 24. Round | 05/02/2017 | RCD Mallorca B | - | CF Gavà | 2:1 |  |
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