| 1. Round | 22/08/2016 | Real Zaragoza | - | UCAM Murcia CF | 3:1 | ||||
| 5. Round | 17/09/2016 | Real Zaragoza | - | AD Alcorcón | 2:0 | ||||
| 6. Round | 20/09/2016 | Gimnàstic de Tarragona | - | Real Zaragoza | 0:0 | ||||
| 7. Round | 25/09/2016 | CD Numancia | - | Real Zaragoza | 2:1 | ||||
| 9. Round | 08/10/2016 | Sevilla Atlético | - | Real Zaragoza | 2:1 | ||||
| 10. Round | 16/10/2016 | Real Zaragoza | - | Elche CF | 1:3 | ||||
| 12. Round | 29/10/2016 | Real Zaragoza | - | UD Almería | 2:1 | ||||
| 13. Round | 05/11/2016 | RCD Mallorca | - | Real Zaragoza | 2:2 | ||||
| 14. Round | 13/11/2016 | Real Zaragoza | - | CD Mirandés | 2:0 | ||||
| 15. Round | 20/11/2016 | Getafe CF | - | Real Zaragoza | 1:0 | ||||
| 16. Round | 26/11/2016 | Real Zaragoza | - | CF Reus Deportiu | 2:2 | ||||
| 17. Round | 03/12/2016 | Cádiz CF | - | Real Zaragoza | 3:0 | ||||
| 23. Round | 29/01/2017 | Real Zaragoza | - | CD Lugo | 1:1 | ||||
| 31. Round | 26/03/2017 | Elche CF | - | Real Zaragoza | 0:3 | ||||
| 38. Round | 12/05/2017 | Real Zaragoza | - | Cádiz CF | 1:1 |
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