| 1. Round | 27/08/2006 | Ciudad de Murcia | - | Polideportivo Ejido | 3:0 | ||||
| 2. Round | 02/09/2006 | Xerez CD | - | Ciudad de Murcia | 2:0 | ||||
| 3. Round | 09/09/2006 | Ciudad de Murcia | - | Real Valladolid | 1:0 | ||||
| 4. Round | 16/09/2006 | Lorca Deportiva | - | Ciudad de Murcia | 1:0 | ||||
| 5. Round | 24/09/2006 | Ciudad de Murcia | - | SD Ponferradina | 1:1 | ||||
| 6. Round | 01/10/2006 | Elche CF | - | Ciudad de Murcia | 1:2 | ||||
| 7. Round | 08/10/2006 | Ciudad de Murcia | - | Málaga CF | 2:0 |  |
|||
| 10. Round | 28/10/2006 | CD Tenerife | - | Ciudad de Murcia | 1:0 | ||||
| 21. Round | 21/01/2007 | Ciudad de Murcia | - | UD Salamanca | 1:0 | ||||
| 22. Round | 28/01/2007 | Polideportivo Ejido | - | Ciudad de Murcia | 2:0 | ||||
| 23. Round | 03/02/2007 | Ciudad de Murcia | - | Xerez CD | 1:0 | ||||
| 24. Round | 11/02/2007 | Real Valladolid | - | Ciudad de Murcia | 1:0 | ||||
| 25. Round | 17/02/2007 | Ciudad de Murcia | - | Lorca Deportiva | 2:1 | |
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| 26. Round | 25/02/2007 | SD Ponferradina | - | Ciudad de Murcia | 1:0 | |
|||
| 28. Round | 11/03/2007 | Málaga CF | - | Ciudad de Murcia | 0:0 | |
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