| 1. Round | 20/08/2016 | AD Alcorcón | - | SD Huesca | 0:0 | ||||
| 2. Round | 28/08/2016 | SD Huesca | - | Gimnàstic de Tarragona | 1:1 | ||||
| 3. Round | 04/09/2016 | Real Zaragoza | - | SD Huesca | 1:0 | ||||
| 4. Round | 11/09/2016 | SD Huesca | - | Córdoba CF | 3:0 | ||||
| 5. Round | 18/09/2016 | Sevilla Atlético | - | SD Huesca | 2:0 | ||||
| 7. Round | 24/09/2016 | Real Valladolid | - | SD Huesca | 1:2 |  |
 |
||
| 8. Round | 01/10/2016 | SD Huesca | - | UD Almería | 2:0 | |
|||
| 17. Round | 04/12/2016 | CD Tenerife | - | SD Huesca | 1:1 | |
|||
| 18. Round | 10/12/2016 | SD Huesca | - | UCAM Murcia CF | 5:2 | ||||
| 20. Round | 06/01/2017 | CD Numancia | - | SD Huesca | 0:0 | ||||
| 21. Round | 15/01/2017 | SD Huesca | - | Levante UD | 0:2 | ||||
| 22. Round | 21/01/2017 | SD Huesca | - | AD Alcorcón | 0:1 | ||||
| 23. Round | 28/01/2017 | Gimnàstic de Tarragona | - | SD Huesca | 0:0 | ||||
| 24. Round | 04/02/2017 | SD Huesca | - | Real Zaragoza | 2:3 | ||||
| 26. Round | 19/02/2017 | SD Huesca | - | Sevilla Atlético | 2:1 | ||||
| 39. Round | 20/05/2017 | UCAM Murcia CF | - | SD Huesca | 3:1 | ||||
| 41. Round | 04/06/2017 | SD Huesca | - | CD Numancia | 0:0 | ||||
| 42. Round | 10/06/2017 | Levante UD | - | SD Huesca | 1:2 |
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