| 12. Round | 17/11/2024 | UD Alzira | - | Atlético Baleares | 1:0 | ||||
| 16. Round | 14/12/2024 | Atlético Baleares | - | RCD Mallorca B | 3:0 | ||||
| 17. Round | 22/12/2024 | CD Ibiza | - | Atlético Baleares | 0:1 | ||||
| 18. Round | 12/01/2025 | CE Europa | - | Atlético Baleares | 3:1 | ||||
| 19. Round | 18/01/2025 | Atlético Baleares | - | Lleida Esportiu | 1:1 |  |
|||
| 20. Round | 26/01/2025 | Peña Deportiva | - | Atlético Baleares | 0:0 | ||||
| 21. Round | 02/02/2025 | Atlético Baleares | - | UE Cornellà | 1:1 | ||||
| 22. Round | 09/02/2025 | Terrassa FC | - | Atlético Baleares | 1:1 | ||||
| 23. Round | 16/02/2025 | Atlético Baleares | - | UE Sant Andreu | 1:1 | ||||
| 24. Round | 23/02/2025 | CF Badalona Futur | - | Atlético Baleares | 0:2 | ||||
| 25. Round | 02/03/2025 | Atlético Baleares | - | CE Sabadell | 1:0 | ||||
| 26. Round | 08/03/2025 | Valencia CF B | - | Atlético Baleares | 0:1 | ||||
| 27. Round | 16/03/2025 | Atlético Baleares | - | UE Olot | 2:2 | ||||
| 28. Round | 23/03/2025 | Torrent CF | - | Atlético Baleares | 0:1 | ||||
| 29. Round | 30/03/2025 | Atlético Baleares | - | UD Alzira | 3:0 | ||||
| 33. Round | 27/04/2025 | RCD Mallorca B | - | Atlético Baleares | 0:3 | ||||
| 34. Round | 04/05/2025 | Atlético Baleares | - | CD Ibiza | 2:0 |
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