| 1. Round | 24/08/2019 | Real Sociedad B | - | Burgos CF | 1:1 | ||||
| 2. Round | 01/09/2019 | Burgos CF | - | CD Alavés B | 1:1 | ||||
| 4. Round | 15/09/2019 | Burgos CF | - | CD Calahorra | 0:1 | ||||
| 5. Round | 22/09/2019 | Cultural Leonesa | - | Burgos CF | 4:0 | ||||
| 7. Round | 06/10/2019 | CD Tudelano | - | Burgos CF | 2:2 | ||||
| 8. Round | 13/10/2019 | Burgos CF | - | CA Osasuna B | 3:2 | ||||
| 9. Round | 19/10/2019 | Arenas de Getxo | - | Burgos CF | 0:2 | ||||
| 10. Round | 27/10/2019 | Burgos CF | - | SD Amorebieta | 1:2 | ||||
| 11. Round | 03/11/2019 | Real Unión | - | Burgos CF | 0:1 | ||||
| 12. Round | 10/11/2019 | Burgos CF | - | Athletic Club B | 2:0 | ||||
| 13. Round | 17/11/2019 | UD Logroñés | - | Burgos CF | 3:0 | ||||
| 14. Round | 24/11/2019 | Burgos CF | - | Real Valladolid B | 0:1 |  |
|||
| 15. Round | 01/12/2019 | Burgos CF | - | Unionistas CF | 0:3 | ||||
| 16. Round | 07/12/2019 | CD Guijuelo | - | Burgos CF | 3:0 | ||||
| 17. Round | 15/12/2019 | Burgos CF | - | CD Izarra | 1:1 | |
|||
| 19. Round | 05/01/2020 | Burgos CF | - | Barakaldo CF | 1:0 | ||||
| 20. Round | 12/01/2020 | Burgos CF | - | Real Sociedad B | 0:2 |
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