| 1. Round | 28/08/2011 | AO Kerkyra | - | Panathinaikos | 0:2 | ||||
| 3. Round | 17/09/2011 | Atromitos | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 6. Round | 16/10/2011 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 2:3 | ||||
| 7. Round | 22/10/2011 | Panathinaikos | - | Ergotelis | 4:0 | ||||
| 13. Round | 11/12/2011 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 14. Round | 17/12/2011 | Panathinaikos | - | Asteras Tripolis | 3:1 | ||||
| 15. Round | 04/01/2012 | Panetolikos | - | Panathinaikos | 1:1 |  |
|||
| 16. Round | 08/01/2012 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 24. Round | 11/03/2012 | AEK Athen | - | Panathinaikos | 2:0 | ||||
| 25. Round | 17/03/2012 | Panathinaikos | - | Olympiakos Piraeus | 0:3 | ||||
| 27. Round | 01/04/2012 | Panathinaikos | - | Aris Saloniki | 1:0 | ||||
| 28. Round | 08/04/2012 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 3:0 | ||||
| 29. Round | 18/04/2012 | Asteras Tripolis | - | Panathinaikos | 0:2 | ||||
| 30. Round | 22/04/2012 | Panathinaikos | - | Panetolikos | 4:0 |
France