| 22. Round | 03/02/2024 | Real Murcia | - | San Fernando CD | 3:0 | ||||
| 23. Round | 11/02/2024 | San Fernando CD | - | Recreativo Huelva | 1:1 | ||||
| 24. Round | 17/02/2024 | Antequera CF | - | San Fernando CD | 2:1 |  |
|||
| 25. Round | 24/02/2024 | San Fernando CD | - | Atlético Madrid B | 0:0 | ||||
| 26. Round | 03/03/2024 | CD Castellón | - | San Fernando CD | 1:0 | ||||
| 27. Round | 10/03/2024 | San Fernando CD | - | Mérida AD | 0:1 | ||||
| 28. Round | 17/03/2024 | Atlético Baleares | - | San Fernando CD | 0:2 | ||||
| 29. Round | 23/03/2024 | Córdoba CF | - | San Fernando CD | 1:0 | ||||
| 30. Round | 31/03/2024 | San Fernando CD | - | UD Ibiza | 1:0 | |
|||
| 31. Round | 06/04/2024 | CD Alcoyano | - | San Fernando CD | 1:1 | ||||
| 32. Round | 13/04/2024 | San Fernando CD | - | CF Intercity | 1:1 | |
|||
| 33. Round | 21/04/2024 | Recreativo Granada | - | San Fernando CD | 5:0 | ||||
| 34. Round | 27/04/2024 | San Fernando CD | - | Real Madrid Castilla | 1:3 | ||||
| 35. Round | 05/05/2024 | UD Melilla | - | San Fernando CD | 1:0 | ||||
| 36. Round | 12/05/2024 | San Fernando CD | - | Málaga CF | 1:1 | ||||
| 37. Round | 18/05/2024 | Atlético Sanluqueño CF | - | San Fernando CD | 0:1 | ||||
| 38. Round | 25/05/2024 | San Fernando CD | - | Linares Deportivo | 2:1 | |
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