| 1. Round | 27/08/2006 | Ciudad de Murcia | - | Polideportivo Ejido | 3:0 | ||||
| 6. Round | 01/10/2006 | Elche CF | - | Ciudad de Murcia | 1:2 | ||||
| 12. Round | 12/11/2006 | UD Almería | - | Ciudad de Murcia | 3:1 | ||||
| 17. Round | 16/12/2006 | Ciudad de Murcia | - | Albacete | 2:1 | ||||
| 21. Round | 21/01/2007 | Ciudad de Murcia | - | UD Salamanca | 1:0 | ||||
| 23. Round | 03/02/2007 | Ciudad de Murcia | - | Xerez CD | 1:0 | ||||
| 24. Round | 11/02/2007 | Real Valladolid | - | Ciudad de Murcia | 1:0 | ||||
| 28. Round | 11/03/2007 | Málaga CF | - | Ciudad de Murcia | 0:0 | ||||
| 29. Round | 17/03/2007 | Ciudad de Murcia | - | Real Madrid Castilla | 0:0 | ||||
| 30. Round | 25/03/2007 | UD Vecindario | - | Ciudad de Murcia | 0:1 |  |
|||
| 31. Round | 01/04/2007 | Ciudad de Murcia | - | CD Tenerife | 2:1 | ||||
| 35. Round | 28/04/2007 | Ciudad de Murcia | - | CD Castellón | 1:1 | ||||
| 36. Round | 05/05/2007 | Hércules CF | - | Ciudad de Murcia | 1:1 | ||||
| 37. Round | 12/05/2007 | Ciudad de Murcia | - | CD Alavés | 5:1 | ||||
| 38. Round | 20/05/2007 | Albacete | - | Ciudad de Murcia | 2:2 | ||||
| 39. Round | 26/05/2007 | Ciudad de Murcia | - | CD Numancia | 1:0 | |
|||
| 40. Round | 02/06/2007 | Sporting Gijón | - | Ciudad de Murcia | 4:3 |
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