| 20. Round | 17/01/1999 | KFC Germinal Ekeren | - | K.S.C. Eendracht Aalst | 1:0 | ||||
| 21. Round | 24/01/1999 | K.S.C. Eendracht Aalst | - | KAA Gent | 0:2 | ||||
| 23. Round | 13/02/1999 | K.S.C. Eendracht Aalst | - | KRC Genk | 1:2 | ||||
| 24. Round | 27/02/1999 | Lommelse SK | - | K.S.C. Eendracht Aalst | 0:3 | ||||
| 25. Round | 07/03/1999 | K.S.C. Eendracht Aalst | - | KV Kortrijk | 1:1 | ||||
| 27. Round | 21/03/1999 | K.S.C. Eendracht Aalst | - | RSC Charleroi | 2:2 | ||||
| 28. Round | 03/04/1999 | KRC Harelbeke | - | K.S.C. Eendracht Aalst | 5:1 |
Spain