| 13. Round | 01/11/2013 | AJ Auxerre | - | Tours FC | 4:0 |  |
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| 17. Round | 13/12/2013 | AJ Auxerre | - | Chamois Niortais | 2:0 | ||||
| 18. Round | 20/12/2013 | Havre AC | - | AJ Auxerre | 2:0 | ||||
| 19. Round | 10/01/2014 | AJ Auxerre | - | AC Arles-Avignon | 1:1 | |
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| 20. Round | 17/01/2014 | Nîmes Olympique | - | AJ Auxerre | 2:2 | ||||
| 21. Round | 27/01/2014 | AJ Auxerre | - | RC Lens | 1:2 | |
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| 23. Round | 07/02/2014 | AJ Auxerre | - | FC Istres | 1:0 | |
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| 26. Round | 28/02/2014 | CA Bastia | - | AJ Auxerre | 0:0 | ||||
| 27. Round | 07/03/2014 | AJ Auxerre | - | Dijon FCO | 2:2 | ||||
| 28. Round | 14/03/2014 | Stade Lavallois | - | AJ Auxerre | 3:0 | |
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| 29. Round | 21/03/2014 | US Créteil-Lusitanos | - | AJ Auxerre | 0:2 | ||||
| 30. Round | 28/03/2014 | AJ Auxerre | - | ESTAC Troyes | 0:0 | |
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| 31. Round | 04/04/2014 | Tours FC | - | AJ Auxerre | 2:2 |  |
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| 33. Round | 19/04/2014 | SM Caen | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 34. Round | 26/04/2014 | AJ Auxerre | - | FC Metz | 0:3 | ||||
| 35. Round | 02/05/2014 | Chamois Niortais | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 36. Round | 06/05/2014 | AJ Auxerre | - | Havre AC | 2:1 | ||||
| 37. Round | 09/05/2014 | AC Arles-Avignon | - | AJ Auxerre | 0:2 | ||||
| 38. Round | 16/05/2014 | AJ Auxerre | - | AS Nancy Lorraine | 0:0 |
France