| 22. Round | 04/02/2024 | Málaga CF | - | Atlético Baleares | 3:0 | ||||
| 23. Round | 11/02/2024 | Atlético Baleares | - | Antequera CF | 2:1 |  |
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| 24. Round | 18/02/2024 | Atlético Madrid B | - | Atlético Baleares | 3:0 | ||||
| 25. Round | 25/02/2024 | Atlético Baleares | - | CD Castellón | 0:1 | ||||
| 27. Round | 10/03/2024 | Córdoba CF | - | Atlético Baleares | 2:0 | ||||
| 28. Round | 17/03/2024 | Atlético Baleares | - | San Fernando CD | 0:2 | ||||
| 29. Round | 24/03/2024 | CD Alcoyano | - | Atlético Baleares | 1:1 | ||||
| 30. Round | 31/03/2024 | Atlético Baleares | - | Real Madrid Castilla | 0:1 | ||||
| 31. Round | 07/04/2024 | Recreativo Huelva | - | Atlético Baleares | 0:0 | ||||
| 32. Round | 14/04/2024 | Atlético Baleares | - | UD Ibiza | 0:1 | |
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| 33. Round | 21/04/2024 | AD Ceuta FC | - | Atlético Baleares | 2:1 | |
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| 34. Round | 28/04/2024 | Atlético Baleares | - | CF Intercity | 1:2 | ||||
| 35. Round | 05/05/2024 | Algeciras CF | - | Atlético Baleares | 1:0 | ||||
| 36. Round | 12/05/2024 | Atlético Baleares | - | Linares Deportivo | 3:1 | |
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| 37. Round | 18/05/2024 | UD Melilla | - | Atlético Baleares | 2:0 | ||||
| 38. Round | 25/05/2024 | Atlético Baleares | - | Recreativo Granada | 2:1 |
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