| 1. Round | 21/08/2016 | CD Numancia | - | Levante UD | 0:1 | ||||
| 2. Round | 26/08/2016 | Getafe CF | - | CD Numancia | 0:0 | ||||
| 3. Round | 04/09/2016 | CD Numancia | - | AD Alcorcón | 1:1 | ||||
| 4. Round | 10/09/2016 | CF Reus Deportiu | - | CD Numancia | 1:1 | ||||
| 5. Round | 17/09/2016 | CD Numancia | - | Gimnàstic de Tarragona | 1:0 | ||||
| 6. Round | 20/09/2016 | Cádiz CF | - | CD Numancia | 1:0 |  |
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| 8. Round | 02/10/2016 | Real Oviedo | - | CD Numancia | 2:2 | ||||
| 11. Round | 22/10/2016 | CD Numancia | - | Sevilla Atlético | 1:2 | ||||
| 12. Round | 30/10/2016 | Girona FC | - | CD Numancia | 3:0 | ||||
| 13. Round | 06/11/2016 | CD Numancia | - | Elche CF | 2:2 | ||||
| 14. Round | 12/11/2016 | CD Tenerife | - | CD Numancia | 1:1 | |
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| 15. Round | 19/11/2016 | CD Numancia | - | Real Valladolid | 2:1 | ||||
| 16. Round | 26/11/2016 | UCAM Murcia CF | - | CD Numancia | 3:2 | |
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| 17. Round | 03/12/2016 | CD Numancia | - | UD Almería | 1:0 | ||||
| 18. Round | 11/12/2016 | CD Lugo | - | CD Numancia | 3:1 | ||||
| 19. Round | 18/12/2016 | CD Numancia | - | RCD Mallorca | 3:1 |
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