| 18. Round | 12/01/2025 | RCD Mallorca B | - | Peña Deportiva | 1:0 | ||||
| 19. Round | 19/01/2025 | Peña Deportiva | - | CE Europa | 1:2 | ||||
| 20. Round | 26/01/2025 | Peña Deportiva | - | Atlético Baleares | 0:0 | ||||
| 21. Round | 02/02/2025 | Terrassa FC | - | Peña Deportiva | 1:0 | ||||
| 22. Round | 09/02/2025 | Peña Deportiva | - | CF Badalona Futur | 3:1 | ||||
| 23. Round | 16/02/2025 | Valencia CF B | - | Peña Deportiva | 2:0 | ||||
| 24. Round | 23/02/2025 | Peña Deportiva | - | Torrent CF | 1:1 |  |
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| 25. Round | 02/03/2025 | Espanyol Barcelona B | - | Peña Deportiva | 1:1 | |
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| 26. Round | 09/03/2025 | Peña Deportiva | - | CE Andratx | 1:3 | ||||
| 27. Round | 16/03/2025 | CD Ibiza | - | Peña Deportiva | 2:1 | |
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| 28. Round | 23/03/2025 | Peña Deportiva | - | Lleida Esportiu | 0:0 | ||||
| 29. Round | 30/03/2025 | UE Cornellà | - | Peña Deportiva | 4:2 | ||||
| 30. Round | 06/04/2025 | Peña Deportiva | - | UE Sant Andreu | 2:2 | |
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| 32. Round | 20/04/2025 | Peña Deportiva | - | UE Olot | 0:0 | ||||
| 33. Round | 27/04/2025 | UD Alzira | - | Peña Deportiva | 0:2 | |
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| 34. Round | 04/05/2025 | Peña Deportiva | - | Elche Ilicitano | 1:1 | |
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