| 1. Round | 21/08/2016 | CD Numancia | - | Levante UD | 0:1 |  |
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| 4. Round | 10/09/2016 | CF Reus Deportiu | - | CD Numancia | 1:1 | ||||
| 5. Round | 17/09/2016 | CD Numancia | - | Gimnàstic de Tarragona | 1:0 | ||||
| 6. Round | 20/09/2016 | Cádiz CF | - | CD Numancia | 1:0 | ||||
| 11. Round | 22/10/2016 | CD Numancia | - | Sevilla Atlético | 1:2 | ||||
| 12. Round | 30/10/2016 | Girona FC | - | CD Numancia | 3:0 | ||||
| 15. Round | 19/11/2016 | CD Numancia | - | Real Valladolid | 2:1 | ||||
| 16. Round | 26/11/2016 | UCAM Murcia CF | - | CD Numancia | 3:2 | ||||
| 24. Round | 04/02/2017 | AD Alcorcón | - | CD Numancia | 2:3 | ||||
| 28. Round | 05/03/2017 | Real Zaragoza | - | CD Numancia | 3:0 | ||||
| 33. Round | 09/04/2017 | CD Numancia | - | Girona FC | 0:2 | ||||
| 34. Round | 15/04/2017 | Elche CF | - | CD Numancia | 1:3 |  |
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| 37. Round | 06/05/2017 | CD Numancia | - | UCAM Murcia CF | 1:0 | ||||
| 40. Round | 28/05/2017 | RCD Mallorca | - | CD Numancia | 0:0 | ||||
| 41. Round | 04/06/2017 | SD Huesca | - | CD Numancia | 0:0 | |
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| 42. Round | 11/06/2017 | CD Numancia | - | CD Mirandés | 0:2 |
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