| 1. Round | 25/08/2024 | Mérida AD | - | Recreativo Huelva | 3:3 | ||||
| 3. Round | 06/09/2024 | Mérida AD | - | Algeciras CF | 1:0 | ||||
| 4. Round | 15/09/2024 | Real Murcia | - | Mérida AD | 2:0 | ||||
| 6. Round | 29/09/2024 | Marbella FC | - | Mérida AD | 1:0 | ||||
| 10. Round | 27/10/2024 | Mérida AD | - | CD Alcoyano | 2:2 | ||||
| 11. Round | 03/11/2024 | AD Alcorcón | - | Mérida AD | 2:2 |  |
|||
| 12. Round | 10/11/2024 | Mérida AD | - | AD Ceuta FC | 1:1 | ||||
| 13. Round | 17/11/2024 | Atlético Madrid B | - | Mérida AD | 1:0 | ||||
| 14. Round | 23/11/2024 | Mérida AD | - | CF Intercity | 2:1 | |
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| 24. Round | 15/02/2025 | CF Intercity | - | Mérida AD | 3:1 | ||||
| 27. Round | 08/03/2025 | Mérida AD | - | Atlético Sanluqueño CF | 3:2 |  |
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| 29. Round | 21/03/2025 | Mérida AD | - | Yeclano Deportivo | 1:0 | |
|||
| 30. Round | 30/03/2025 | CD Alcoyano | - | Mérida AD | 2:3 | ||||
| 31. Round | 06/04/2025 | Mérida AD | - | Sevilla Atlético | 2:1 | ||||
| 32. Round | 13/04/2025 | Hércules CF | - | Mérida AD | 0:0 | ||||
| 33. Round | 20/04/2025 | CF Fuenlabrada | - | Mérida AD | 1:1 |  |
|||
| 34. Round | 27/04/2025 | Mérida AD | - | Antequera CF | 3:0 |
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