| 11. Round | 28/10/2012 | Real Madrid Castilla | - | Sporting Gijón | 2:4 | ||||
| 12. Round | 04/11/2012 | SD Huesca | - | Real Madrid Castilla | 2:2 |  |
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| 13. Round | 12/11/2012 | Real Madrid Castilla | - | Recreativo Huelva | 0:1 | ||||
| 14. Round | 18/11/2012 | CD Mirandés | - | Real Madrid Castilla | 0:0 | ||||
| 16. Round | 30/11/2012 | Real Murcia | - | Real Madrid Castilla | 0:0 | |
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| 17. Round | 09/12/2012 | Real Madrid Castilla | - | Racing Santander | 4:0 | ||||
| 20. Round | 05/01/2013 | AD Alcorcón | - | Real Madrid Castilla | 3:2 | ||||
| 21. Round | 13/01/2013 | Real Madrid Castilla | - | Girona FC | 0:0 | ||||
| 22. Round | 19/01/2013 | Real Madrid Castilla | - | Villarreal CF | 5:0 | ||||
| 23. Round | 27/01/2013 | FC Barcelona B | - | Real Madrid Castilla | 3:1 | ||||
| 24. Round | 04/02/2013 | Real Madrid Castilla | - | UD Almería | 2:1 | ||||
| 25. Round | 09/02/2013 | Xerez CD | - | Real Madrid Castilla | 0:1 | |
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| 40. Round | 26/05/2013 | Elche CF | - | Real Madrid Castilla | 1:1 | ||||
| 42. Round | 08/06/2013 | Girona FC | - | Real Madrid Castilla | 1:1 |
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