| 1. Round | 20/08/2016 | Elche CF | - | Rayo Vallecano | 2:1 | ||||
| 35. Round | 22/04/2017 | Rayo Vallecano | - | CD Lugo | 2:0 | ||||
| 36. Round | 01/05/2017 | SD Huesca | - | Rayo Vallecano | 2:0 | ||||
| 37. Round | 06/05/2017 | Rayo Vallecano | - | Levante UD | 2:1 | ||||
| 38. Round | 13/05/2017 | AD Alcorcón | - | Rayo Vallecano | 2:0 | ||||
| 42. Round | 09/06/2017 | Sevilla Atlético | - | Rayo Vallecano | 1:2 |
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