| 1. Round | 13/09/1999 | Stabæk IF | - | Deportivo La Coruña | 1:0 | ||||
| 1. Round | 29/09/1999 | Deportivo La Coruña | - | Stabæk IF | 2:0 | ||||
| 2. Round | 18/10/1999 | Deportivo La Coruña | - | Montpellier HSC | 3:1 |  |
|||
| 2. Round | 03/11/1999 | Montpellier HSC | - | Deportivo La Coruña | 0:2 | |
|||
| 3. Round | 24/11/1999 | Deportivo La Coruña | - | Panathinaikos | 4:2 | |
|||
| Round of 16 | 01/03/2000 | Arsenal FC | - | Deportivo La Coruña | 5:1 | ||||
| Round of 16 | 08/03/2000 | Deportivo La Coruña | - | Arsenal FC | 2:1 |
Portugal