| 6. Round | 10/09/2016 | KV Mechelen | - | Sint-Truidense VV | 2:0 |  |
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| 7. Round | 17/09/2016 | Sint-Truidense VV | - | Waasland-Beveren | 4:1 | ||||
| 10. Round | 15/10/2016 | Sint-Truidense VV | - | KVC Westerlo | 2:2 | ||||
| 11. Round | 23/10/2016 | KRC Genk | - | Sint-Truidense VV | 1:0 | |
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| 12. Round | 26/10/2016 | Sint-Truidense VV | - | SV Zulte Waregem | 0:2 | ||||
| 13. Round | 29/10/2016 | Sint-Truidense VV | - | Sporting Charleroi | 2:2 | ||||
| 14. Round | 05/11/2016 | KAS Eupen | - | Sint-Truidense VV | 4:2 | |
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| 15. Round | 18/11/2016 | Sint-Truidense VV | - | Club Brugge KV | 0:1 | |
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| 16. Round | 26/11/2016 | Sporting Lokeren | - | Sint-Truidense VV | 1:0 | ||||
| 17. Round | 03/12/2016 | Sint-Truidense VV | - | Royal Excel Mouscron | 1:0 | |
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| 22. Round | 22/01/2017 | RSC Anderlecht | - | Sint-Truidense VV | 3:1 | ||||
| 25. Round | 05/02/2017 | KVC Westerlo | - | Sint-Truidense VV | 1:0 | ||||
| 26. Round | 10/02/2017 | Sint-Truidense VV | - | KRC Genk | 0:3 | |
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