| 1. Round | 29/07/2016 | Gazélec FC Ajaccio | - | Stade Brestois 29 | 0:0 | ||||
| 2. Round | 05/08/2016 | AJ Auxerre | - | Gazélec FC Ajaccio | 1:2 | ||||
| 3. Round | 12/08/2016 | Gazélec FC Ajaccio | - | Havre AC | 1:1 | ||||
| 4. Round | 19/08/2016 | Stade Lavallois | - | Gazélec FC Ajaccio | 0:1 | ||||
| 5. Round | 26/08/2016 | Gazélec FC Ajaccio | - | RC Strasbourg | 1:1 | ||||
| 6. Round | 09/09/2016 | Stade de Reims | - | Gazélec FC Ajaccio | 2:0 | ||||
| 9. Round | 23/09/2016 | Gazélec FC Ajaccio | - | Nîmes Olympique | 0:2 | ||||
| 11. Round | 14/10/2016 | ESTAC Troyes | - | Gazélec FC Ajaccio | 1:0 | ||||
| 12. Round | 21/10/2016 | Gazélec FC Ajaccio | - | US Orléans | 2:0 | ||||
| 27. Round | 24/02/2017 | Nîmes Olympique | - | Gazélec FC Ajaccio | 1:1 | ||||
| 28. Round | 03/03/2017 | Gazélec FC Ajaccio | - | Tours FC | 2:2 | ||||
| 30. Round | 17/03/2017 | US Orléans | - | Gazélec FC Ajaccio | 1:1 | ||||
| 31. Round | 31/03/2017 | Gazélec FC Ajaccio | - | FC Bourg-Péronnas | 2:3 | ||||
| 32. Round | 08/04/2017 | Red Star FC | - | Gazélec FC Ajaccio | 0:3 | ||||
| 33. Round | 14/04/2017 | Gazélec FC Ajaccio | - | Clermont Foot 63 | 4:4 | ||||
| 34. Round | 21/04/2017 | FC Sochaux | - | Gazélec FC Ajaccio | 1:2 |
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