| 5. Round | 30/09/2023 | Utebo FC | - | CD Calahorra | 1:0 | ||||
| 16. Round | 17/12/2023 | CD Calahorra | - | CD Alavés B | 0:2 | ||||
| 17. Round | 07/01/2024 | Real Zaragoza B | - | CD Calahorra | 0:0 | ||||
| 18. Round | 13/01/2024 | UD Mutilvera | - | CD Calahorra | 0:2 | ||||
| 19. Round | 21/01/2024 | CD Calahorra | - | AD San Juan | 1:1 | ||||
| 21. Round | 04/02/2024 | CD Calahorra | - | Barakaldo CF | 1:1 | ||||
| 22. Round | 11/02/2024 | CD Calahorra | - | Utebo FC | 1:0 |  |
|||
| 23. Round | 18/02/2024 | CD Tudelano | - | CD Calahorra | 1:1 | ||||
| 24. Round | 25/02/2024 | CD Calahorra | - | Náxara CD | 2:2 |  |
|||
| 25. Round | 03/03/2024 | Real Sociedad C | - | CD Calahorra | 1:2 | ||||
| 26. Round | 10/03/2024 | CD Calahorra | - | SD Gernika | 0:1 | ||||
| 27. Round | 17/03/2024 | CD Brea | - | CD Calahorra | 0:2 | ||||
| 28. Round | 24/03/2024 | CD Calahorra | - | UD Logroñés | 0:1 | ||||
| 29. Round | 30/03/2024 | Athletic Club B | - | CD Calahorra | 2:1 | ||||
| 30. Round | 07/04/2024 | CD Calahorra | - | UD Barbastro | 1:0 | ||||
| 31. Round | 14/04/2024 | CD Izarra | - | CD Calahorra | 2:1 | ||||
| 32. Round | 21/04/2024 | CD Calahorra | - | CD Valle de Egüés | 3:0 | |
|||
| 33. Round | 28/04/2024 | CD Alavés B | - | CD Calahorra | 3:2 | ||||
| 34. Round | 05/05/2024 | CD Calahorra | - | Real Zaragoza B | 4:3 | |
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