| 1. Round | 26/08/2023 | Olympique Saint-Quentin | - | FC Bourg-Péronnas | 0:4 |  |
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| 2. Round | 02/09/2023 | FC Bourg-Péronnas | - | AS Furiani-Agliani | 1:1 | ||||
| 3. Round | 09/09/2023 | FC Fleury 91 | - | FC Bourg-Péronnas | 0:1 | ||||
| 4. Round | 16/09/2023 | SR Colmar | - | FC Bourg-Péronnas | 1:1 | ||||
| 6. Round | 07/10/2023 | Racing Besançon | - | FC Bourg-Péronnas | 2:1 | ||||
| 15. Round | 03/02/2024 | FC Bourg-Péronnas | - | FC Fleury 91 | 0:4 | ||||
| 16. Round | 17/02/2024 | FC Bourg-Péronnas | - | SR Colmar | 1:0 | ||||
| 18. Round | 09/03/2024 | FC Bourg-Péronnas | - | Racing Besançon | 1:0 | |
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| 19. Round | 16/03/2024 | FC 93 Bobigny | - | FC Bourg-Péronnas | 2:2 |  |
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| 22. Round | 13/04/2024 | FC Bourg-Péronnas | - | Entente Feignies Aulnoye | 3:0 | ||||
| 23. Round | 20/04/2024 | ASC Biesheim | - | FC Bourg-Péronnas | 0:2 | ||||
| 24. Round | 26/04/2024 | FC Bourg-Péronnas | - | ES Wasquehal | 3:0 | ||||
| 25. Round | 11/05/2024 | AJ Auxerre B | - | FC Bourg-Péronnas | 2:0 | ||||
| 26. Round | 18/05/2024 | FC Bourg-Péronnas | - | Olympique Saint-Quentin | 5:3 |
France