| 1. Round | 10/08/2019 | Bourges Foot | - | FC Sète | 4:0 | ||||
| 2. Round | 17/08/2019 | FC Sète | - | US Colomiers | 2:0 | ||||
| 3. Round | 24/08/2019 | SO Romorantin | - | FC Sète | 3:0 | ||||
| 4. Round | 31/08/2019 | FC Sète | - | FC Chamalières | 2:0 |  |
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| 8. Round | 05/10/2019 | Montpellier HSC B | - | FC Sète | 2:4 | |
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| 9. Round | 19/10/2019 | FC Sète | - | Vendée Les Herbiers | 1:1 | ||||
| 10. Round | 01/11/2019 | Angoulême CFC | - | FC Sète | 1:3 |  |
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| 11. Round | 09/11/2019 | FC Sète | - | Blois Foot 41 | 2:0 | ||||
| 13. Round | 30/11/2019 | FC Sète | - | AS Saint-Étienne B | 2:1 | ||||
| 14. Round | 14/12/2019 | Bergerac Périgord FC | - | FC Sète | 2:2 | ||||
| 15. Round | 20/12/2019 | FC Sète | - | St-Pryvé St-Hilaire | 1:0 | |
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| 16. Round | 11/01/2020 | US Colomiers | - | FC Sète | 0:1 | ||||
| 17. Round | 25/01/2020 | FC Sète | - | SO Romorantin | 0:0 | ||||
| 19. Round | 15/02/2020 | FC Sète | - | Andrézieux-Bouthéon FC | 4:0 | |
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| 21. Round | 07/03/2020 | Trélissac FC | - | FC Sète | 0:1 | |
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