| 3. Round | 01/09/2012 | Girona FC | - | SD Ponferradina | 1:0 | ||||
| 14. Round | 16/11/2012 | Sporting Gijón | - | SD Ponferradina | 2:3 | ||||
| 15. Round | 25/11/2012 | SD Ponferradina | - | SD Huesca | 2:1 | ||||
| 16. Round | 02/12/2012 | Recreativo Huelva | - | SD Ponferradina | 0:2 | ||||
| 17. Round | 09/12/2012 | SD Ponferradina | - | CD Mirandés | 3:1 | ||||
| 18. Round | 16/12/2012 | CD Numancia | - | SD Ponferradina | 0:1 | ||||
| 19. Round | 22/12/2012 | SD Ponferradina | - | Real Murcia | 1:0 | ||||
| 20. Round | 05/01/2013 | Racing Santander | - | SD Ponferradina | 2:1 | ||||
| 21. Round | 13/01/2013 | SD Ponferradina | - | CD Lugo | 0:1 | ||||
| 22. Round | 20/01/2013 | SD Ponferradina | - | Elche CF | 1:1 | ||||
| 23. Round | 27/01/2013 | AD Alcorcón | - | SD Ponferradina | 1:0 |  |
|||
| 31. Round | 23/03/2013 | Xerez CD | - | SD Ponferradina | 1:2 | ||||
| 34. Round | 14/04/2013 | Córdoba CF | - | SD Ponferradina | 0:1 | ||||
| 35. Round | 20/04/2013 | SD Ponferradina | - | Sporting Gijón | 1:0 | ||||
| 40. Round | 26/05/2013 | Real Murcia | - | SD Ponferradina | 0:2 | ||||
| 41. Round | 02/06/2013 | SD Ponferradina | - | Racing Santander | 2:2 |
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