| 3. Round | 06/09/2024 | Mérida AD | - | Algeciras CF | 1:0 | ||||
| 5. Round | 21/09/2024 | Mérida AD | - | UD Ibiza | 1:0 | ||||
| 6. Round | 29/09/2024 | Marbella FC | - | Mérida AD | 1:0 | ||||
| 7. Round | 06/10/2024 | Mérida AD | - | Villarreal CF B | 1:1 | ||||
| 8. Round | 12/10/2024 | Antequera CF | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 9. Round | 20/10/2024 | Mérida AD | - | Real Betis B | 1:1 | ||||
| 10. Round | 27/10/2024 | Mérida AD | - | CD Alcoyano | 2:2 | ||||
| 11. Round | 03/11/2024 | AD Alcorcón | - | Mérida AD | 2:2 |  |
|||
| 12. Round | 10/11/2024 | Mérida AD | - | AD Ceuta FC | 1:1 | ||||
| 13. Round | 17/11/2024 | Atlético Madrid B | - | Mérida AD | 1:0 | ||||
| 15. Round | 30/11/2024 | Real Madrid Castilla | - | Mérida AD | 6:0 | ||||
| 16. Round | 08/12/2024 | Mérida AD | - | Hércules CF | 2:1 | ||||
| 17. Round | 14/12/2024 | Yeclano Deportivo | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 18. Round | 21/12/2024 | Mérida AD | - | CF Fuenlabrada | 2:1 | ||||
| 19. Round | 10/01/2025 | Sevilla Atlético | - | Mérida AD | 1:0 |
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