| 1. Round | 12/08/2023 | Real Zaragoza | - | Villarreal CF B | 2:0 | ||||
| 5. Round | 10/09/2023 | Racing Ferrol | - | Villarreal CF B | 2:2 | ||||
| 7. Round | 24/09/2023 | Villarreal CF B | - | SD Amorebieta | 3:1 | ||||
| 14. Round | 04/11/2023 | Villarreal CF B | - | Sporting Gijón | 0:3 | ||||
| 18. Round | 04/12/2023 | Villarreal CF B | - | SD Eibar | 1:0 | ||||
| 19. Round | 08/12/2023 | Albacete | - | Villarreal CF B | 2:0 | ||||
| 40. Round | 20/05/2024 | Villarreal CF B | - | Albacete | 2:2 | ||||
| 41. Round | 26/05/2024 | Real Valladolid | - | Villarreal CF B | 3:2 | ||||
| 42. Round | 02/06/2024 | Villarreal CF B | - | Racing Santander | 1:0 |  |
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