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| 29/08/2012 | 17:30 | SD Noja | - | SD Amorebieta | 3:2 (0:2, 2:2) aet | |
| 18:00 | CE L'Hospitalet | - | Orihuela CF | 1:0 (0:0) | ||
| 18:30 | Caudal Deportivo | - | CD Marino | 2:0 (0:0) | ||
| 18:30 | AE Prat | - | Gimnàstic de Tarragona | 2:1 | ||
| 19:00 | CD Laudio | - | SD Eibar | 0:1 | ||
| 19:00 | SD Ejea | - | Peña Sport FC | 4:2 (0:0, 0:0) aet | ||
| 19:00 | CD Alcoyano | - | Atlético Baleares | 2:0 (0:0) | ||
| 19:00 | UE Llagostera | - | CF Badalona | 1:0 | ||
| 19:00 | Albacete | - | Loja CD | 4:0 (0:0) | ||
| 19:00 | Catarroja CF | - | CD Alavés | 0:2 (0:0) | ||
| 19:00 | SD Logroñés | - | UD Logroñés | 2:1 | ||
| 19:30 | CD Ourense | - | Real Ávila CF | 2:1 (0:0) | ||
| 19:30 | CD Constància | - | Yeclano Deportivo | 3:0 | ||
| 19:30 | Cádiz CF | - | CD San Roque | 3:2 (0:0) | ||
| 19:30 | Arroyo CP | - | La Roda CF | 2:1 aet | ||
| 19:30 | CP Villarrobledo | - | CP Cacereño | 1:3 | ||
| 30/08/2012 | 19:30 | Real Oviedo | - | CF Fuenlabrada | 2:0 (0:0) | |
| 20:30 | Atlético Sanluqueño CF | - | FC Cartagena | 1:0 (0:0) |
