| 2. Round | 03/09/2016 | Calcio Padova | - | UC AlbinoLeffe | 1:1 | ||||
| 3. Round | 10/09/2016 | Calcio Padova | - | Forlì FC | 2:0 | ||||
| 4. Round | 13/09/2016 | Alma Juventus Fano | - | Calcio Padova | 3:1 |  |
|||
| 13. Round | 12/11/2016 | Calcio Padova | - | Feralpisalò | 2:1 | ||||
| 15. Round | 28/11/2016 | Venezia FC | - | Calcio Padova | 1:3 | ||||
| 17. Round | 07/12/2016 | Ancona 1905 | - | Calcio Padova | 2:2 | ||||
| 20. Round | 23/12/2016 | Calcio Padova | - | Sambenedettese | 1:0 | ||||
| 21. Round | 30/12/2016 | UC AlbinoLeffe | - | Calcio Padova | 0:3 | ||||
| 26. Round | 19/02/2017 | Mantova FC | - | Calcio Padova | 0:1 | ||||
| 28. Round | 05/03/2017 | AC Reggiana | - | Calcio Padova | 1:1 | |
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| 30. Round | 19/03/2017 | Modena FC | - | Calcio Padova | 0:1 | ||||
| 31. Round | 26/03/2017 | Calcio Padova | - | Bassano Virtus | 1:0 | ||||
| 33. Round | 05/04/2017 | Calcio Padova | - | Parma Calcio 1913 | 1:2 | ||||
| 37. Round | 30/04/2017 | FC Südtirol | - | Calcio Padova | 1:0 | ||||
| 38. Round | 07/05/2017 | Calcio Padova | - | AC Lumezzane | 2:0 |
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