| 1. Round | 21/08/2016 | Atalanta | - | Lazio Roma | 3:4 |  |
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| 2. Round | 28/08/2016 | Sampdoria | - | Atalanta | 2:1 | |
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| 3. Round | 11/09/2016 | Atalanta | - | Torino FC | 2:1 | ||||
| 6. Round | 26/09/2016 | FC Crotone | - | Atalanta | 1:3 | ||||
| 12. Round | 06/11/2016 | Sassuolo Calcio | - | Atalanta | 0:3 | ||||
| 13. Round | 20/11/2016 | Atalanta | - | AS Roma | 2:1 | ||||
| 35. Round | 07/05/2017 | Udinese Calcio | - | Atalanta | 1:1 | |
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| 38. Round | 27/05/2017 | Atalanta | - | Chievo Verona | 1:0 |
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