| 1. Round | 28/08/2016 | ACR Messina | - | Siracusa Calcio 1924 | 3:1 |  |
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| 2. Round | 05/09/2016 | Siracusa Calcio 1924 | - | Foggia Calcio | 1:2 | ||||
| 3. Round | 11/09/2016 | Taranto FC | - | Siracusa Calcio 1924 | 0:0 | ||||
| 4. Round | 14/09/2016 | Siracusa Calcio 1924 | - | SS Monopoli 1966 | 1:1 | ||||
| 5. Round | 18/09/2016 | Juve Stabia | - | Siracusa Calcio 1924 | 2:0 | ||||
| 6. Round | 25/09/2016 | Siracusa Calcio 1924 | - | US Lecce | 0:2 | ||||
| 7. Round | 02/10/2016 | AS Melfi | - | Siracusa Calcio 1924 | 2:2 | ||||
| 10. Round | 23/10/2016 | Fondi | - | Siracusa Calcio 1924 | 2:0 | |
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| 11. Round | 30/10/2016 | Siracusa Calcio 1924 | - | Fidelis Andria | 1:1 | ||||
| 12. Round | 06/11/2016 | Reggina 1914 | - | Siracusa Calcio 1924 | 0:2 | ||||
| 13. Round | 13/11/2016 | Siracusa Calcio 1924 | - | Akragas | 4:2 | ||||
| 14. Round | 20/11/2016 | Casertana FC | - | Siracusa Calcio 1924 | 2:0 | ||||
| 17. Round | 06/12/2016 | Paganese Calcio | - | Siracusa Calcio 1924 | 1:1 |
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