| 20. Round | 06/01/2024 | Virtus Verona | - | Atalanta II | 0:1 | ||||
| 21. Round | 13/01/2024 | Atalanta II | - | Trento Calcio 1921 | 1:0 | ||||
| 22. Round | 20/01/2024 | Giana Erminio | - | Atalanta II | 0:0 | ||||
| 24. Round | 04/02/2024 | Pro Vercelli | - | Atalanta II | 1:1 | ||||
| 25. Round | 10/02/2024 | Atalanta II | - | L.R. Vicenza | 1:2 |  |
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| 28. Round | 26/02/2024 | FC Legnago Salus | - | Atalanta II | 1:1 | ||||
| 30. Round | 05/03/2024 | Atalanta II | - | FC Lumezzane | 1:0 | ||||
| 31. Round | 11/03/2024 | US Fiorenzuola | - | Atalanta II | 2:1 | |
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| 36. Round | 13/04/2024 | Calcio Padova | - | Atalanta II | 2:0 | ||||
| 38. Round | 28/04/2024 | Arzignano Valchiampo | - | Atalanta II | 1:1 | |
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