| 27. Round | 08/03/2009 | AC Milan | - | Atalanta | 3:0 |  |
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| 28. Round | 15/03/2009 | Atalanta | - | Torino FC | 2:0 | ||||
| 29. Round | 22/03/2009 | US Lecce | - | Atalanta | 2:2 | |
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| 30. Round | 05/04/2009 | Atalanta | - | ACF Fiorentina | 1:2 |  |
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| 34. Round | 03/05/2009 | Udinese Calcio | - | Atalanta | 3:0 | |
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| 35. Round | 10/05/2009 | Atalanta | - | Genoa CFC | 1:1 | ||||
| 36. Round | 17/05/2009 | Juventus | - | Atalanta | 2:2 | ||||
| 37. Round | 24/05/2009 | Atalanta | - | US Palermo | 2:2 |
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