| 7. Round | 01/10/2016 | Calcio Padova | - | Mantova FC | 0:0 | ||||
| 8. Round | 08/10/2016 | SS Maceratese | - | Mantova FC | 1:0 | ||||
| 10. Round | 22/10/2016 | Parma Calcio 1913 | - | Mantova FC | 1:0 |  |
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| 11. Round | 29/10/2016 | Mantova FC | - | AC Reggiana | 2:3 | ||||
| 12. Round | 05/11/2016 | SSD Città di Teramo | - | Mantova FC | 0:1 | ||||
| 14. Round | 19/11/2016 | Forlì FC | - | Mantova FC | 4:1 | |
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| 15. Round | 26/11/2016 | Mantova FC | - | AS Gubbio | 0:3 | ||||
| 16. Round | 04/12/2016 | Mantova FC | - | Santarcangelo | 3:1 | |
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| 17. Round | 07/12/2016 | AC Lumezzane | - | Mantova FC | 2:0 | |
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| 18. Round | 11/12/2016 | Mantova FC | - | Modena FC | 1:0 | ||||
| 19. Round | 18/12/2016 | FC Südtirol | - | Mantova FC | 1:0 | ||||
| 20. Round | 23/12/2016 | Mantova FC | - | Ancona 1905 | 3:2 | ||||
| 22. Round | 21/01/2017 | Mantova FC | - | Sambenedettese | 1:1 | ||||
| 23. Round | 29/01/2017 | Pordenone Calcio | - | Mantova FC | 0:0 | ||||
| 35. Round | 15/04/2017 | Santarcangelo | - | Mantova FC | 1:2 |
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