| 7. Round | 02/10/2016 | AS Melfi | - | Siracusa Calcio 1924 | 2:2 | ||||
| 9. Round | 16/10/2016 | Vibonese Calcio | - | Siracusa Calcio 1924 | 0:0 |  |
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| 10. Round | 23/10/2016 | Fondi | - | Siracusa Calcio 1924 | 2:0 |  |
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| 13. Round | 13/11/2016 | Siracusa Calcio 1924 | - | Akragas | 4:2 | ||||
| 19. Round | 17/12/2016 | Virtus Francavilla | - | Siracusa Calcio 1924 | 3:1 | ||||
| 20. Round | 22/12/2016 | Siracusa Calcio 1924 | - | ACR Messina | 2:0 | ||||
| 21. Round | 29/12/2016 | Foggia Calcio | - | Siracusa Calcio 1924 | 3:0 | ||||
| 22. Round | 21/01/2017 | Siracusa Calcio 1924 | - | Taranto FC | 0:0 | ||||
| 23. Round | 28/01/2017 | SS Monopoli 1966 | - | Siracusa Calcio 1924 | 1:1 | ||||
| 24. Round | 04/02/2017 | Siracusa Calcio 1924 | - | Juve Stabia | 3:2 | ||||
| 25. Round | 11/02/2017 | US Lecce | - | Siracusa Calcio 1924 | 2:1 | |
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| 26. Round | 18/02/2017 | Siracusa Calcio 1924 | - | AS Melfi | 3:1 | ||||
| 36. Round | 23/04/2017 | Siracusa Calcio 1924 | - | Paganese Calcio | 2:0 | |
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